Родился в 1822 году в Ичетуйской долине в семье казачьего пятидесятника Банзара Боргонова. Родители решили обучить Доржи русской грамоте и в сентябре 1833 года отдали его в Троицко – Савскую войсковую русско-монгольскую школу. Мальчик учился легко и успешно, ко всему проявлял любознательность, обнаружил блестящие способности и отлично окончил курс школы. В 1835 году Доржи в числе четырех бурятских мальчиков был отправлен в Казань в гимназию. Умный и одаренный юноша в июне 1842 года с золотой медалью окончил 1-ю Казанскую гимназию и в том же году поступил на филологическое отделение философского факультета Казанского университета.В 1846 году Доржи окончил университет и защитил диссертацию на тему «Черная вера или шаманство у монголов». Диссертация, как одна из лучших, в том же году была напечатана в «ученых записках Казанского университета». Первооткрывателю тайн Черной веры Доржи Банзарову, как сыну казака, нужно было прослужить двадцать лет на службе, но решением государственного Совета он был освобожден от этой повинности и назначен чиновником особых поручений при генерал-губернаторе Восточной Сибири.

Внёс большой вклад в различные отрасли востоковедения, оставив заметный след и обогатив сокровищницу отечественного востоковедения трудами, не потерявшими своего научного значения и в наши дни.